Центр действует на базе автономного учреждения Астраханской области «Астраханский областной инновационный центр» и при поддержке министерства экономического развития Астраханской области.

Учредителем учреждения является Астраханская область. Функции и полномочия учредителя от имени Астраханской области осуществляются Министерством имущественных и градостроительных отношений Астраханской области и Министерством экономического развития Астраханской области